Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPKQ9UHJ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHPKQ9UHJ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms