Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SRP68Q9UHB9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SRP68Q9UHB9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRP68Q9UHB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms