Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF20Q9UGU0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF20Q9UGU0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms