Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT8Q9UFF9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT8Q9UFF9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT8Q9UFF9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms