Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1BQ9UEU0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms