Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFDP1Q9UEE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFDP1Q9UEE9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFDP1Q9UEE9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CFDP1Q9UEE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms