Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBD2Q9UBB5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms