Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp6ap1Q9R1Q9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp6ap1Q9R1Q9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms