Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hsf4Q9R0L1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hsf4Q9R0L1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms