Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NrkQ9R0G8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NrkQ9R0G8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
NrkQ9R0G8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
NrkQ9R0G8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms