Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A1

Clcn2, Chloride channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn2Q9R0A1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn2Q9R0A1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn2Q9R0A1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn2Q9R0A1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms