Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AmfrQ9R049 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmfrQ9R049 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms