Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d3cQ9QZS8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh2d3cQ9QZS8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh2d3cQ9QZS8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d3cQ9QZS8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d3cQ9QZS8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d3cQ9QZS8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms