Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3Q9QZS0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3Q9QZS0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col4a3Q9QZS0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3Q9QZS0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms