Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxe3Q9QY14 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxe3Q9QY14 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxe3Q9QY14 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms