Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn4Q9QXZ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn4Q9QXZ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Opn4Q9QXZ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn4Q9QXZ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn4Q9QXZ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn4Q9QXZ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn4Q9QXZ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn4Q9QXZ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn4Q9QXZ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn4Q9QXZ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms