Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf354bQ9QXT9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf354bQ9QXT9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf354bQ9QXT9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf354bQ9QXT9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf354bQ9QXT9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms