Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP35Q9P2H5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP35Q9P2H5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms