Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMSAP3Q9P1Y5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMSAP3Q9P1Y5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMSAP3Q9P1Y5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms