Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD4Q9NZQ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD4Q9NZQ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms