Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHCHD3Q9NX63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD3Q9NX63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD3Q9NX63 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms