Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHP2Q9NX24 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NHP2Q9NX24 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms