Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARPBPQ9NWS1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PARPBPQ9NWS1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARPBPQ9NWS1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms