Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA3Q9NST1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms