Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFCQ9NRA1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFCQ9NRA1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFCQ9NRA1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms