Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CD163L1Q9NR16 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CD163L1Q9NR16 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CD163L1Q9NR16 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CD163L1Q9NR16 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms