Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPNPEP3Q9NQH7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPNPEP3Q9NQH7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms