Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RTN4Q9NQC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTN4Q9NQC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms