Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A20Q9NP91 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A20Q9NP91 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A20Q9NP91 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms