Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPHS2Q9NP85 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPHS2Q9NP85 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms