Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdgfl3Q9JMG7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl3Q9JMG7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms