Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm2bQ9JME9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm2bQ9JME9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vstm2bQ9JME9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.6 ms