Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PnkpQ9JLV6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PnkpQ9JLV6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnkpQ9JLV6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms