Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cabp1Q9JLK7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cabp1Q9JLK7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Cabp1Q9JLK7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cabp1Q9JLK7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms