Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF4

Clec6a, C-type lectin domain family 6 member A, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec6aQ9JKF4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec6aQ9JKF4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec6aQ9JKF4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms