Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ap3m1Q9JKC8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ap3m1Q9JKC8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ap3m1Q9JKC8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ap3m1Q9JKC8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ap3m1Q9JKC8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ap3m1Q9JKC8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ap3m1Q9JKC8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ap3m1Q9JKC8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms