Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc22Q9JIG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc22Q9JIG7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc22Q9JIG7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms