Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK4

ROBO2, Roundabout homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO2Q9HCK4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ROBO2Q9HCK4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ROBO2Q9HCK4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ROBO2Q9HCK4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ROBO2Q9HCK4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ROBO2Q9HCK4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms