Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRPEL1Q9HAV7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRPEL1Q9HAV7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRPEL1Q9HAV7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRPEL1Q9HAV7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRPEL1Q9HAV7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GRPEL1Q9HAV7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms