Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPO2LQ9H987 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNPO2LQ9H987 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2LQ9H987 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms