Protein–RNA interactions for Protein: Q9H977

WDR54, WD repeat-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR54Q9H977 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR54Q9H977 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR54Q9H977 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR54Q9H977 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR54Q9H977 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR54Q9H977 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR54Q9H977 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR54Q9H977 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR54Q9H977 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms