Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP3Q9H6T3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP3Q9H6T3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms