Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0M0

WWP1, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP1, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP1Q9H0M0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP1Q9H0M0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP1Q9H0M0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
WWP1Q9H0M0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WWP1Q9H0M0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms