Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1EQ9GZS1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms