Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C20orf27Q9GZN8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C20orf27Q9GZN8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C20orf27Q9GZN8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms