Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn12Q9ET43 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn12Q9ET43 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms