Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OtofQ9ESF1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OtofQ9ESF1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OtofQ9ESF1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms