Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aff4Q9ESC8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms