Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tfip11Q9ERA6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tfip11Q9ERA6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms