Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Clstn2Q9ER65 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Clstn2Q9ER65 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clstn2Q9ER65 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Clstn2Q9ER65 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms